Type de document : article scientifique publié dans Veterinary Research
Auteurs : Billy Bauzile, Benoit Durand, Sébastien Lambert, Séverine Rautureau, Lisa Fourtune, Claire Guinat, Alessio Andronico, Simon Cauchemez, Mathilde C. Paul, Timothée Vergne
Résumé en français (traduction) : Impact de la densité de palmipèdes sur la résilience du secteur avicole face à l’influenza aviaire hautement pathogène H5N8 en France
Nous avons analysé l’interaction entre la densité des élevages de palmipèdes et la vulnérabilité du système de production avicole à l’influenza aviaire hautement pathogène (IAHP) H5N8. Pour ce faire, nous avons utilisé un modèle de transmission spatialement explicite, qui a été calibré pour reproduire la distribution spatio-temporelle observée des foyers en France lors de l’épidémie d’IAHP de 2016-2017. Six scénarios ont été étudiés, dans lesquels la densité des élevages de palmipèdes a été diminuée dans les communes ayant la plus forte densité d’élevages de palmipèdes. Pour chacun des six scénarios, nous avons d’abord calculé la distribution spatiale du nombre de reproduction de base (R0), c’est-à-dire le nombre attendu d’élevages qu’un élevage donné serait susceptible d’infecter, si tous les autres élevages étaient sensibles. Nous avons également effectué des simulations in silico du modèle ajusté pour chaque scénario afin d’estimer la portée des épidémies et les nombres de reproduction efficaces variant dans le temps. Nous avons montré que la réduction de la densité des exploitations de palmipèdes dans les communes les plus denses diminuait considérablement la taille des zones présentant des valeurs R0 élevées (> 1,5). Les simulations in silico suggèrent qu’une réduction, même légère, de la densité des élevages de palmipèdes dans les communes les plus denses devrait diminuer considérablement le nombre d’élevages de volailles touchés et donc profiter à l’ensemble du secteur avicole. Cependant, elles suggèrent également que cela n’aurait pas été suffisant, même en combinaison avec les mesures d’intervention mises en œuvre pendant l’épidémie de 2016-2017, pour empêcher complètement la propagation du virus. Par conséquent, il convient désormais d’évaluer l’efficacité d’autres approches préventives structurelles, notamment la réduction de la taille des troupeaux et la vaccination ciblée.
Résumé en anglais (original) : We analysed the interplay between palmiped farm density and the vulnerability of the poultry production system to highly pathogenic avian influenza (HPAI) H5N8. To do so, we used a spatially-explicit transmission model, which was calibrated to reproduce the observed spatio-temporal distribution of outbreaks in France during the 2016–2017 epidemic of HPAI. Six scenarios were investigated, in which the density of palmiped farms was decreased in the municipalities with the highest palmiped farm density. For each of the six scenarios, we first calculated the spatial distribution of the basic reproduction number (R0), i.e. the expected number of farms a particular farm would be likely to infect, should all other farms be susceptible. We also ran in silico simulations of the adjusted model for each scenario to estimate epidemic sizes and time-varying effective reproduction numbers. We showed that reducing palmiped farm density in the densest municipalities decreased substantially the size of the areas with high R0 values (> 1.5). In silico simulations suggested that reducing palmiped farm density, even slightly, in the densest municipalities was expected to decrease substantially the number of affected poultry farms and therefore provide benefits to the poultry sector as a whole. However, they also suggest that it would not have been sufficient, even in combination with the intervention measures implemented during the 2016–2017 epidemic, to completely prevent the virus from spreading. Therefore, the effectiveness of alternative structural preventive approaches now needs to be assessed, including flock size reduction and targeted vaccination.
Publication ayant donné lieu à un communiqué de presse d’INRAE le 10 juillet 2023 : Impact de la densité d’élevages de canards sur le risque d’influenza aviaire en France
